圆锥角膜通常是由于胶原纤维异常、过敏体质、其他因素等导致的，并且胶原纤维异常也会引起圆锥角膜，由于细胞异常，圆锥角膜病变涉及到角膜中的细胞，即角膜上皮和角膜内皮细胞，这些细胞可能存在功能异常或变异，导致角膜前表面逐渐变薄，丧失对眼球的正常支撑，进而形成圆锥角膜现状，同时遗传因素在圆锥角膜的形成中起着重要的作用，许多研究表明，圆锥角膜与遗传有一定的关联性，而患病个体的家族中往往存在角膜圆锥症的先例，同时胶原纤维比较细，患者角膜的扩张能力相对于正常角膜会比较低，在眼内压的作用下容易发生前凸，进而也会导致角膜锥状的改变。